2009年8月19日，前往小林村寻找罹难者遗体的士兵戴著口罩列队出发。资料照片／记者黄义书摄影
据台湾《联合报》报道，台湾甲型H1N1流感疫情严峻，台湾“中研院”院士陈建仁推估，台湾恐有7千人死亡，前台“疾管局长”苏益仁认为，死亡人数约在5千到1万人之间，若防疫措施没做好，可能会更多。
报道称，甲型H1N1流感疫情随采取防疫措施不同，死亡率约在千分之二至千分之四。陈建仁保守估计，这波甲型H1N1流感疫情疫情，约三分之一可能遭感染，以死亡率千分之一计，台湾约7千人可能丧命。
至于每年流行的季节性流感，死亡率低于千分之一，并发重症及其它感染而死者，每年大约2千到3千人，且绝大部分都是65岁以上老人跟小孩。陈建仁说:“新流感甲型H1N1流感不一样，大多数死亡的会是青壮年，冲击更大”。
苏益仁以介于美国、日本感染率及死亡率的中间模式估算，台湾死亡人数恐介于5千到1万人之间。他预估，当台湾学校开学后疫情会明显走扬，10、11月达到高峰。
他也提醒，今年冬天县市长选举，候选人场子上人口大量聚集，可能增加传播速度。他甚至建议，应视疫情考虑选举暂缓。
但防疫措施做得好，能有效降低死亡人数。陈建仁说，若以每周感染人数1万人、每周感染人数呈倍数成长，到了11月初，感染人数多达1千万人，但若介入措施得当，可控制病患增加速度。
究竟甲型H1N1流感疫情何时能结束，陈建仁也无法预测。“若疫情压不下来，半年内就能结束。疫情控制得好，反而可能会延缓传播速度，流行两三年”。但短期内大量流行绝非好事，陈建仁说，因为短期间内病患骤增，医院所将根本无力负荷。
2009年8月25日，屏县林边地区清理污泥的台军撤除一部分，士兵们戴著口罩，快速奔跑在林边街头准备移动。记者张天雄／摄影
台“中央流行疫情指挥中心”8月24日证实，前往灾区支持救灾的屏东两支台军部队，首度爆发H1N1新流感群聚感染。
据报道，新流感疫情警戒线拉高，“中央流行疫情指挥中心”24日公布，岛内新增2例H1N1新流感死亡病例，即4天内有3例新流感死亡个案。备受关切的灾区果然爆发群聚感染，经确诊病例的部队分别是支持派驻屏东地区东港大潭小学和万金营区台军官兵。
“疾管局”采检5人样本，均呈阳性，其中4件为新流感，一件为季节性流感。目前已对2部队出现类流感症状的台军全数投药治疗。对此，台“卫生署长”杨志良说，群聚感染是不可避免的，目前疫情仍在可控制范围。
2009年8月22日，新开地区台军在挖掘行动时戴著口罩。资料照片 记者张天雄摄影
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